历史上，睢州古城曾历经三次大的变迁。第一次是秦初从承匡城（今匡城乡政府驻地）迁到襄陵附近，即秦汉至北宋末年的襄邑古城，在现在的北湖与通惠渠之间；第二次是从襄邑古城迁到现北湖所在地的襄邑旧城，也即北宋崇宁年间至明末清初的拱州（睢州）旧城；第三次是由睢州旧城迁到旧城南关外的新睢州城，在今日的北湖南岸，当时称新城、凤凰城。

  睢县靠近黄河，历次变迁，无不深深地打上黄河南泛的烙印。黄河每泛滥一次，城外地势就抬高一次，年多日久，导致城内低凹积水，居民只得向城外地势高的地方陆续迁移。睢县城址的三次变迁，都是迫不得已。县（州）城的迁徙并不是短时间内完成的，每次新城的形成，都要经历一个较长的过程。

  秦始皇刚开始时定都在承匡置县，却因为承匡地势低凹积水，只好在襄陵附近改设襄邑县，于是有了襄邑古城。后来也是同样的原因，古城为黄河冲没积水成湖（古人称西湖），居民为避水患，逐渐东迁于城东附近的金锁岭（今北湖公园内，原北关村东西街）、骆驼岭（驼冈）等较高处，至宋朝崇宁年间，始新修一城，习惯上称为旧城，位置就在现在的北湖。明末清初，州城城外地势往往比城内高出不下数丈，一旦城堤崩溃，水必灌入城内，居民便逐渐从旧城迁到南关外的凤凰岭、鞍子岭上。明嘉靖三十七年（1558年），开始构筑新城，城墙长约十二里，高二丈五尺，内土外砖。建有七座城门，城门名称全部和凤凰有关，南门三个，中间是鸣凤门，寓意凤喙，东边是左光门，西边是右光门，寓意为凤凰的左右两个眼睛；东门两个，正东叫朝阳门，东北门叫左翼门；西门叫翙蕤门，小北门叫右翼门。新旧两城相连，旧城正方，新城椭圆，新长旧狭，形如“凸”字，像一只向南展翅飞翔的凤凰，因此俗称凤凰城。当时新城仅有一条东西大街，且中间高，东西两边稍低，所以又被称为“扁担城”。这时旧城中仍有一部分居民，直到明崇祯十五年（1642年）壬午三月，李自成农民军占领睢州，强迫百姓将旧城城垣平毁。九月，黄河泛滥，旧城遂被淹没废弃。新旧二城并存长达一二百年。旧城岁久成湖，成为烟波浩渺、芦苇丛生的地方。新州城随之逐渐发展并繁华起来。

  睢县（州）有许多和凤凰有关的地名、名胜和传说，如“凤城”“凤凰池”“凤凰台”“凤凰岭”“鸣凤楼”等，述说着睢县曾经的辉煌。近年来，睢县县城规模逐渐扩大，原来的三处城址，皆被今日睢县县城覆盖。

  1993年，睢县因其悠久深厚的历史文化，被确定为河南省历史文化名城。

  现在睢县北湖已成城中之湖，整个县城呈现城中有湖、湖中有城、城湖相间的格局。